成都病原微生物宏基因组 mNGS 检测

宏基因组测序mNGS技术，一次检测覆盖31,033种病原体及4,417种耐药基因，突破培养局限，精准锁定重症感染与不明原因发热的致病原。

适用人群

• ICU重症感染患者，病情进展迅速，常规抗生素治疗3天无效需快速明确病原
• 不明原因发热（FUO）患者，常规检查无明确病因，需广谱筛查排除疑难感染
• 免疫缺陷患者（HIV、化疗后、器官移植），机会性感染风险高，难培养病原体需精准检出
• 疑似中枢神经系统感染，脑脊液常规检测阴性但临床高度怀疑，需高灵敏度测序辅助诊断
• 病原体培养阴性但临床高度怀疑感染的患者，如分枝杆菌、立克次体等难培养病原体
• 病毒性感染鉴别诊断，需同时覆盖DNA病毒与RNA病毒（如流感、新冠、巨细胞病毒）的复杂病例

检测内容

本检测基于宏基因组测序（mNGS）技术，对临床样本中所有微生物的基因组进行无偏倚高通量测序，不依赖病原体分离培养，可直接捕获环境中丰度极低甚至痕量的病原体遗传信息。检测流程包括样本前处理、核酸提取、cDNA合成（确保RNA病毒如流感、HIV可被检出）、文库构建、测序及生物信息分析。覆盖范围达31,033种微生物：细菌14,208种（含104种分枝杆菌）、真菌814种、病毒15,720种（DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种）、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。同时可检出4,417种耐药基因（覆盖31种抗生素）及484种毒力基因，为抗生素选择提供直接依据。该方法尤其擅长发现常规培养无法检出的病原体（如胞内菌、厌氧菌、立克次体），但对于未知或新发病原体、样本中病原载量极低或采样不当导致的漏检仍存在局限，且无法区分定植与致病，需结合临床综合判读。

检测流程

采样方式灵活，根据感染部位选择相应样本类型：外周血、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物等均可送检，无需空腹，无特殊准备要求。在成都本地设有采样点或提供上门采样服务，也可通过冷链物流邮寄样本至实验室。样本采集后常规报告周期为3天，重症急诊场景可联系实验室确认加急流程，最快24-48小时出具结果。

准确性说明

方法学上，宏基因组测序直接读取样本中全部微生物基因组序列，通过比对高达31,033种病原体的专用数据库进行识别，理论灵敏度高于传统培养，尤其在抗生素使用后或低载量感染时优势显著。检测全程设置阴性质控样本，通过分析背景菌群（如脓肿分枝杆菌、铜绿假单胞菌等常见环境菌）扣除污染信号，确保报告准确性。结果分为明确病原（高reads、高置信度）、可疑病原（中等reads、需结合临床）和可能定植/污染（低reads、谨慎评估）三类。阳性结果需结合临床症状、影像学及其他实验室指标综合判断，阴性结果不能完全排除感染，可能因病原载量过低、数据库未收录新发病原或非感染性疾病所致。检测同时提供的耐药基因信息（4,417种）可辅助预测抗生素敏感性，但最终用药决策仍需参考传统药敏试验。

详细流程

1. 咨询与评估：临床医生根据患者症状（如重症肺炎、不明原因发热、免疫缺陷感染等）判断适应症，开具检测申请
2. 样本采集：根据感染部位采集对应样本（血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物），无需空腹，无需特殊准备
3. 样本送检：在成都本地可通过采样点或上门服务送检，外地样本支持冷链邮寄
4. 前处理与核酸提取：裂解病原体细胞壁，同时提取DNA和RNA
5. cDNA合成与文库构建：将RNA反转录为cDNA，与DNA一同进行片段化、接头连接，构建测序文库
6. 高通量测序：使用宏基因组测序平台对文库进行深度测序，产出海量序列数据
7. 生物信息分析：将测序数据与包含31,033种微生物、4,417种耐药基因、484种毒力基因的专用数据库比对，识别病原体并定量
8. 报告解读与发放：依据《ABX指南》《临床微生物学手册》等权威文献，结合临床信息出具报告，周期3天，重症可加急

• 检测前无需空腹，但应避免采样前使用抗生素，以免降低病原载量影响检出率
• 样本采集需严格无菌操作，避免环境微生物污染导致假阳性结果
• 本检测不能区分定植菌与致病菌，最终诊断需结合临床症状、影像学及其他实验室检查
• 报告周期为3天，但重症急诊场景可联系实验室确认是否有加急通道
• 阴性结果不能完全排除感染，可能因病原载量过低、采样不当或新发病原未在数据库中
• 检测结果仅供参考，抗生素选择仍需结合传统药敏试验及临床评估
• 本检测不适合作为常规感冒或自限性疾病的筛查，适用于复杂、重症或疑难感染病例